1988年7月，马晓晴到北京拍王朔小说改编的同名电影《顽主》，她把这部影片称为自己的第一部成年影片，她说当时根本不知道王朔。因为在《顽主》中的出色表演，马晓晴获得1989年金鸡奖最佳女配角唯一提名。那届金鸡奖的评委会主席正是带她走上电影之路的谢晋，“谢晋导演当年提出，不要颁奖给我，让年轻女演员这么早就得到大奖，她们拿了奖就会往外国跑。”当时有将近半数金鸡百花最佳女演员得主拿到奖后都出国，其中就包括陈冲、张瑜、斯琴高娃、龚雪等。与大奖失之交臂，马晓晴竟然一点也不恨谢晋，谢晋是她的开门祖师爷。

1992年，马晓晴参加电视剧《北京人在纽约》的拍摄。

1997年，她凭借在《我也有爸爸》中的出色表现获得第17届金鸡奖最佳女配角，成了那个年代炙手可热的女明星。在很长一段时间里，马晓晴体会到了什么是“走红”，“那时我出门要戴墨镜，经常会有服务员站在旁边，看着我吃饭，冲着我嘿嘿地傻笑，我就说：‘你们不要再对我笑了，吓死人了，饭也吃不下了。’”

1999年，她在北京演赖声川的话剧《他和他的两个老婆》，当时穿着三点式就上台了，当时挺轰动。马晓晴和父母住在一起，过着没有男人的生活。

马晓晴走红后，个人生活完全暴露在公众的视线下，她逐渐减慢了拍戏的速度。

2000年后，她从北京回到了上海，逐渐淡出观众的视线，变得越来越沉寂。

2002年，马晓晴自立门户当起了导演，但是由她自编自导的电影《花店》最终没能拍成，这是马晓晴的一个遗憾。《花店》讲述了一个开花店的女孩与服装设计师、警察、歌手、农民工四种不同男人之间的感情纠葛。

回到上海后有几年，马晓晴几乎断绝了与演艺圈的所有联系。电影伤透了她的心，曾经一度不能谈电影，跟谁也不能谈，一谈到电影她就恶心，想吐。

2006年，马晓晴执导了电影处女作《少女》，同年这部电影在央视电影频道播出，影片中的故事改编自她的亲身经历。马晓晴说这部影片讲的是一个断送了的爱情，在这部电影中，她丰富细腻的情感得到了表达，把情窦初开的青涩、惶恐、逃避和矛盾复杂的心情表达出来了。马晓晴说，影片中女孩子和男孩打架的场面，是她小时候的亲身经历。

2008年1月，马晓晴开始着手写电影剧本《素馨》。马晓晴回到上海后，看到了很多人和事，她经常看新闻，《素馨》也属有感而发。

《团圆》是曾红极一时的马晓晴复出之作。在亮相上海首映礼之后，马晓晴昨日也随剧组亮相北京，颇令媒体意外，童星出身的马晓晴，在《团圆》中出演乔玉娥大女儿，电影是马晓晴10年后复出首部作品，此番亮相首映礼又是其复出大银幕后的首度公开场合亮相。

据悉，马晓晴出生于上海一个知识分子家庭，《红楼梦》、《北京，你早》等影视剧令其名噪一时。2000年前后，马晓晴淡出娱乐圈。昨日，马晓晴优雅“贵气”亮相，她颈带项链，手套玉镯。复出态势不同凡响。她话语不多，说话也是轻言细语。提及接演《团圆》复出，马晓晴称，这是因为她和王全安有渊源，“我们一起主演过《北京，你早》，那是20多年前，他演我男朋友。我很崇拜卢燕老师，能演她的女儿，我很荣幸。” [1]

2010年就获柏林电影节银熊奖的《团圆》，时隔三年后昨日终在京举行首映式，影片将于9月19日中秋节上映。昨天下午，导演王全安携主演卢燕、凌峰和多年不见的马晓晴亮相，淡出电影圈十年的马晓晴表示，之所以出演该片是因为曾和王全安在《北京，你早》中出演过情侣，算是替朋友捧场打了回酱油。

导演王全安对马晓晴在《团圆》中的表现相当认同，而马晓晴也了解了这位老朋友的变化，她说自己虽没见过张雨绮，但看过对方的照片和电影，而且一直劝王全安夫妇早点生龙凤胎。王全安表示，他和张雨绮的年龄非常悬殊，想让她再多玩儿几年，“我平时经常跟雨绮说，如果你觉得你已经玩够了，我们可以尝试一下新的生活状态。”至于王菲和李亚鹏离婚的热点新闻，王全安的态度是：“结婚和离婚一样自然，有些人想结有些人想离。”